Согласно завещанию Чингиз-хана улус, его сына Чагатая распространялся от уйгурских земель на востоке до Амударьи на западе, а на юге имел пределом индийские владения. Однако с 70-х годов XIII в. дом Чагатая находился в вассальной зависимости от дома Угэдэя, имевшего владения в Джунгарии, включая верховья Иртыша. Внук Угэдэя Кайду-хан (1269–1301) не только добился подчинения Чагатаев, но и активно воевал с верховными ка’анами из дома Мункэ (Хубилая) за власть над исконно монгольскими землями. После поражения Борак-хана и подчинения ильханами дома Хулагу Никудерийской Орды Чагатаи потеряли контроль над южными областями. Только с постепенным усилением Чагатаида Дува-хана (ок.1274–1306), ставленника и союзника Кайду-хана, появилась перспектива возрождения улуса Чагатая. Воспользовавшись ослаблением центральной власти в улусе Хулагу в последние годы XIII в., Дува-хан инициирует программу регулярных походов чагатайцев на юг.
      В 1295 г. армия Дува-хана вторглась в восточные области Ирана, разорив территории Хорасана и Мазандарана, Йездский оазис и угнав в рабство до 200 тыс. их жителей. В 1297–98 гг. чагатайские войска во главе с Дува-ханом захватывают области Восточного Афганистана. Они отторгают территории караунасов от улуса Хулагу, а затем вторгаются в пределы владений Делийского султаната. Дува-хан отстранил от власти над никудерийцами Абдаллаха и поставил на его место своего сына Кутлуг-Ходжу ([1], С.92), закрепившегося в области Газни. С этого момента и происходит включение караунасов-никудерийцев в орбиту чагатайской истории, последующие полвека которой были временем противостояния трех чингизидских домов: Дувы, Кайду и Никудера. В 1299 г. Кутлуг-Ходжа организует новое вторжение в Северную Индию, дойдя до Лахора и Дели.
        Южные походы Дува-хана и присоединение Никудерийской орды существенно укрепили военно-политический потенциал Чагатаев. Когда в 1301 г. очередной поход Кайду-хана против верховного ка’ана закончился его поражением и смертью, то Дува-хан, разгромив войска сына Кайду-хана, Чапара, основал независимое Чагатайское государство, южными владениями которого стали земли караунасов. В 1303 г. 120-тысячная чагатайская армия совершает новое вторжение в Индию и грабит окрестности Дели. Экспансия Чагатаев заставила Делийский султанат пойти на реорганизацию армии по монгольскому образцу. В 1304 г. новый рейд в пределы Индии совершили 40 тыс. чагатайских всадников во главе с сыном Дува-хана, Кёпеком. Чагатаи успели ограбить области Пенджаба, но потерпели поражение в сражении к востоку от Дели. Плененные военачальники были брошены под ноги слонов, а около 8 тыс. чагатайских воинов обезглавлены. В 1305–1306 гг. Кёпек-хан ограбил область Мултана, но снова был бит делийской армией, потеряв пленными около 50 тыс. человек ([2], С.167).

        После смерти Дува-хана дом Кайду попытался вернуть себе власть. Однако сыновья Дувы отстояли трон отца и возвели на чагатайский трон хана Есунбугу (1309–1316), который возобновил дальние военные походы. В 1312–1313 гг. чагатайская армия во главе с огланами Мансуром и Кёпеком совершает набег на Хорасан. Тогда хулагидские войска переправляются через Амударью и грабят Мавераннахр, а также вторгаются в южные чагатайские владения, бывшие уделом Давуд-Ходжи, сына Кутлуг-Ходжи. Давуд-Ходжа не смог противостоять мощной армии ильхана Олжейту (1304–1316) и отступил на север, за Амударью. Судя по всему, тогда и происходит вытеснение караунасов-никудерийцев на север, в области Кабула, Кундуза и Баглана.
        В ответ на потерю Есунбуга-ханом южных владений чагатайская армия во главе с Давуд-Ходжей и Кёпеком дважды в 1313–1315 гг. вторгается в Хорасан и захватывает окрестности Герата ([3], С.43–44). В 1315 г. Чагатаи одерживают при Мургабе победу над хулагидскими войсками и грабят земли Хорасана. Но в этот момент в область Иссык-Куля входят монгольские императорские войска, и Есунбуга-хан вынужден был срочно отозвать основные силы на восток.
       Одновременно чагатайцев покидают караунасы во главе с Ясавуром Никудери, который решает восстановить самостоятельность Никудерийской Орды и заключает союз с ильханом Олджейту. В итоге армия Олджейту громит войска Кёпека, и чагатайцы теряют все завоевания в Хорасане. В 1316 г. войска Олджейту и Ясавура совершают новое вторжение в Мавераннахр. Хан Есунбуга опять потерпел сокрушительное поражение. Бухара, Самарканд, Термез были разорены, а большая часть их жителей была уведена Ясавуром в Хорасан. Крах военных акций Чагатаев и разгром их главных городов выявили несостоятельность власти Есунбуга, и трон перешел к его брату Кёпеку (1318–1326), прославившемуся денежной реформой и мерами по централизации власти.
      После смерти ильхана Олджейту Ясавур Никудери восстает против Хулагидов и в 1317 г. вторгается в Хорасан. Он добился выплаты контрибуции от жителей Герата, а через год повторным набегом на Герат вынудил нового ильхана, Абу Саида заключить с ним мир. В 1318 г. Ясавур нападает на Систан. В том же году против Ясавура выступает и дает ему сражение Кёпек-хан. В 1319–1320 гг. Ясавур снова осаждает Герат, затем грабит Мазандаран. На сторону Ясавура перешли владетели Бохарза, Фараха и Исфазара ([3], С.45–46,48–49). Тогда во главе борьбы с Ясавуром по приказу ильхана Абу-Саида встает правитель Герата, султан Гияс ад-дин Курт (1307–1329), договорившийся о совместных действиях с Кёпек-ханом. В 1321 г. Ясавур был убит в сражении с войсками Куртов и Чагатаев ([7], С.315), что, видимо, привело к временному подчинению никудерийцев Куртам, а через них – Хулагидам. В том же 1321 г. войска Куртов и Никудерийской орды совершают совместное вторжение в Фарах ([3], С.50).

        Кёпека на чагатайском троне сменили его братья Ильчигидай и Дувва-Тимур, а затем знаменитый Ала ад-дин Тармаширин-хан (1326–1334). Реформы Кёпека принесли свои плоды. Уже в 1327 г. Тармаширин-хан осуществил далекий поход в Индию против Делийского султаната. Его армия вступила в Пенджаб и ограбила земли долины от Лахора и Мультана вплоть до Дели ([2], С.175). Военная акция такого масштаба была возможна лишь в случае, если была восстановлена власть чагатайских ханов над караунасами-никудерийцами. Султан Дели запросил мира и выплатил огромную контрибуцию золотом и драгоценными камнями. На обратном пути армия Тармаширин-хана ограбила Синд и Гуджарат.
        Тармаширин принял ислам и по примеру Кёпека держал ставку в Мавераннахре, где его посетил в 30-е годы XIV в. арабский путешественник Ибн Баттута. Однако происламская ориентация Тармаширина вызвала его конфронтацию с беками восточных чагатайских племен, которые обвинили его в отступлении от «Ясы» Чингиз-хана, в частности в том, что он в течение четырех лет не собирал курултай Чингизидов и не выезжал к войску в восточную ставку. Восточные Чагатаи подняли мятеж и, избрав на курултае 1333–1334 гг. своего хана, Бузуна, выступили под его началом в Мавераннахр. Тармаширин пытался бежать, но был схвачен. По утверждению Ибн Батуты, ему и его детям удалось скрыться и уйти в Индию ([5], С.87–90). После этого ханская ставка была перенесена в Семиречье, что означало смещение политического центра Чагатайского улуса на восток.

       Следующий период, вплоть до захвата власти амиром Казаганом, представлен противоречивыми данными и остается «белым пятном» чагатайской истории. Так, Ибн Баттута сообщает, что хан Бузун «…стал притеснять мусульман, несправедливо обращался с подданными и позволял христианам и иудеям строить храмы» и это послужило поводом для выступления против него мусульман во главе с сыном Ясавура Никудери – султаном Халилем ([5], С.90). Однако ведущие темуридские историки Шараф ад-дин Йазди и Фасих Хавафи ничего не знают о султане Халиле и утверждают, что в 1332–1333 гг. чагатайский трон перешел к дому Никудера в лице сына Ясавура Казан-хана, который правил до 1346–1347 гг. ([3], С.57,74) .
       В начале XX в. английский ученый С.Лэн-Пуль смещает приход к власти Казан-хана на 1343 г., а между ним и Тармаширином умещает четырех правителей из дома Дувы и одного потомка Угэдэя – султана Али (1342–1346) ([6], С.462–463). В Таласском кладе, найденом в 1928 г., имеются три монеты чекана султана Халиля. Год чекана на них не определен, но авторитетнейший историк М.Е.Массон отнес эти монеты к 1342-1344 гг. ([9], С.69), когда после путешествия Ибн Баттуты прошло десятилетие. Напомним, что С.Лэн-Пуль свою реконструкцию называл предположительной и достаточно сомнительной ([6], С.462), а Бартольд В.В. заявил, что «…установить в дальнейшем отдельные события почти невозможно, так как между сообщениями историков, пожалуй, малодостоверными в этом вопросе, и рассказом, также романтически окрашенным, путешественника Ибн Баттуты существует непримиримое противоречие» ([4], С.543). Одной из причин таких разночтений мог быть урон, причиненный городской культуре Средней Азии «великой чумой» 40–50-х годов XIV в., последствием которой был, без сомнения, разрыв летописных традиций.
      Вопреки сомнениям ведущих историков, в XX в. «по умолчанию» произошла канонизация одной из версий, согласно которой Казан-хан добивается верховной власти в Чагатайском улусе только в 1343 г., когда возвращает ханскую ставку в Мавераннахр и строит западнее Карши дворец Занжир Сарай. Его предшественниками на чагатайском троне объявлены ханы дома Дувы и Угэдэя, а султан Халил оказался забыт.

      Согласно Ибн Баттуте, в борьбе с ханом Бузуном султану Халилю оказали помощь правитель Герата, султан Му‘изз ад-дин Курт (1331–1370) и правитель Термеза, худавандзаде Ала ал-Мулк. Поход против Бузуна носил характер священной войны – газавата, и при первом столкновении чагатайские войска Бузуна перешли к Халилю. Далее султан Халиль одержал победу над войском восточных чагатайских беков близ Тараза. Укрепившись в Чагатайском улусе, он потребовал подчинения себе правителя Герата, но в войне с султаном Му‘изз ад-дином потерпел поражение и был взят в плен ([5], С.90–92).
      Версия Ибн Баттуты сходится с версией темуридских историков в том, что в первой половине 30-х годов XIV в. дом Никудера одержал верх над домом Дувы и захватил центральный чагатайский трон. Учитывая представленную здесь информацию об обособленности и потенциале караунасов-никудерийцев, можно предположить, что Чагатайский улус уже с середины 30-х годов XIV в. был разделен на две части. Тогда «канонизированная» версия относится к истории центральной и восточной части улуса, где правили ханы домов Дувы и Кайду. Южная же, происламская группа во главе с караунасами имела своего хана из дома Никудера. Ханы (султаны) из дома Никудера: Халиль и Казан – могли быть одним лицом или разными фигурами – союзниками султана Герата. Информация Баттуты о пленении Халиля косвенно отражает факт временной зависимости никудерийцев от Куртов. Отметим также, что в 1342 г. караунасы-никудерийцы входили в состав войска Му‘изз ад-дина Курта, громившего хорасанских сербедаров ([7], С.321). Зафиксированный в «канонизированной» версии рубеж 1343 г. мог быть временем выдвижения ставки хана южной чагатайской группировки с юга на север и захвата им центральной области улуса.
      Предположение о более раннем политическом разделении Чагатаев подтверждается данными о религиозном противостоянии восточной и западной частей улуса, начиная с Тармаширин-хана. Западная область твердо стоит на исламских позициях, а восточная ориентируется на христианство, буддизм и придерживается «Ясы» Чингиз-хана. Возможно, караунасы первыми среди чагатайцев обратились в ислам, что и определило их лидерство в борьбе за веру. Восточные же племена после Бузуна провозгласили ханом Дженкши, который покровительствовал буддистам и католикам ([8], С.40). Уже при султане Али произошли столкновения христиан с мусульманами, приведшие к гибели католической миссии. Перенос Казан-ханом ставки в Мавераннахр мог также отражать победу мусульманской религиозной традиции и окончательное обращение в ислам центральных чагатайских племен.

      В 1344–1345 гг. политическая ситуация в Чагатайском улусе меняется. Караунасы, которые к этому времени контролировали окрестности Кабула, левобережье Амударьи в пределах Хульма, Кундуза, Баглана, обрели сильного лидера амира Казагана и вновь стали претендовать на первенство в регионе, но уже в отрыве от дома Никудера. Амиру Казагану удается сплотить вокруг караунасов южную группу чагатайских племен, занимавшую территории от Железных ворот до южных отрогов Гиндукуша и включавшую также каучинов, арлатов, сулдузов, апардов и хутталянцев. Казаган начинает проводить политику, независимую от Куртов и Казан-хана. Этим временем Йазди и Хавафи датируют жалобу амиру Казагану со стороны амиров апардов и арлатов, а также шейхов Джама, упрекавших султана Му‘изз ад-дина Курта в том, «что он назвал себя султаном и живет с большим излишеством, чем ему полагается». В ответ Казаган объявил Му‘изз ад-дину Курту войну.
      В 1345 г. Казагану нанес поражение Казан-хан. Казаган-бек потерял в битве один глаз и отступил. Но уже весной 1346 г. Казаган-бек отомстил Казан-хану, разбив войско последнего в сражении у Карши. Сам Казан-хан был убит. Эта победа позволила Казагану узурпировать власть в Чагатайском улусе. Он первым возвел на чагатаидский престол подставного хана-Чингизида, сохранив за собой как верховным амиром улуса всю полноту власти. Политически это означало подчинение южной группе и центральных чагатайских племен: барласов, ясауров и джалаиров. В ответ на это обособилась восточная чагатайская группа, где на трон был возведен Токлуг-Тимур-хан (1348–1362) из дома Дува-хана.
       В 1350–1352 гг. амир Казаган наносит ряд пораженией Му’изз ад-дину Курту и захватывает Герат. В 1353 г. он присоединяет к сфере чагатайских владений Хорезм. В 1358 г. амир Казаган был убит в результате заговора и ему наследовал его сын Абдаллах. Если Казаган держал свою ставку в пределах владений караунасов, то Абдаллах решил перенести ее в Мавераннахр, что вызвало отрицательную реакцию со стороны центральной коалиции племен. В 1359 г. амиры барласов и сулдузов убили подставного хана Абд-Аллаха и его братьев, а самого амира изгнали на юг, в земли караунасов, где он вскоре и умер. После этого лидером южной группы становится внук Казагана, амир Хусейн, центром владений которого была область Кабула.
       Конфликт между центральной и южной группами создал благоприятные условия для вторжения в Мавераннахр восточных Чагатаев во главе с ханом Тоглук-Тимуром в 1360 и 1361 гг.. Земли Мавераннахра стали ареной борьбы между восточными Чагатаями во главе с ханами Моголистана и южными Чагатаями во главе с амиром Хусейном. Моголы дошли до Гиндукуша, но не перешли его. Это означает, что основные земли караунасов остались вне поля их влияния. В течение 1361–1364 гг. амир караунасов Хусейн при поддержке амира барласов Амира Темура изгнал моголов из пределов Мавераннахра и вновь объединил центральную и южную чагатайские группы.

      Амир Темур как амир барласов в период противостояния с моголами присоединился к южной чагатайской группе, а в 1370 г. добился ее подчинения своему влиянию. В решающий момент борьбы с амиром Хусейном на его сторону перешли апарды, сулдузы, хутталянцы и хазарейцы Хульма. Залогом военно-политического успеха Сохибкирана Темура стало то, что ему удалось привлечь на свою сторону караунасов, с которыми у него сложились крепкие связи в период южного «казачества» (первая половина 70-х годов XIV в.) в областях Кандагара и Систана. Ближайшим соратником Амира Темура стал амир Ходжа Сайф ад-дин из дома Никудера, выдвинувшийся в крупнейшие военначальники Сохибкирана: в 1382–1383 гг. он вместе с амиром Ак-Бугой подавлял восстание гератцев ([7], С.326), в 1383–1384 гг. его армия взяла Кандагар ([3], С.102,107). В походах 1391 и 1395 гг. против Тохтамыша Ходжа Сайф ад-дин возглавлял правый канбул армии Темура.
      Все годы правления Сохибкирана караунасская армия была его надежной опорой и важнейшей частью вооруженных сил. Уже в 1372 г. области Кабула, Кундуза и Баглана были переданы в управление другому соратнику Амира Темура Джаку Барласу (ум.1383/84). Он принял командование над караунасcкой армией численностью не менее 3 туменов. Опираясь на караунасов, Сохибкиран твердо контролировал южную чагатайскую группу и подчинил центральную группу, подавив в 1372–73 гг. мятеж ясауров, а в 1376 г. – джалаиров. Все три тумена караунасов участвовали в походе 1391 г. против Тохтамыша. Джаку Барласу наследовал сын Джаханшах, командовавший левым крылом армии Амира Темура в походах 1395 г. против Тохтамыша и 1399 г. в Индию. Не случайно центральную часть удела внука и преемника Сохибкирана – Пир-Мухаммада Кабули также составляли земли караунасов.
      Грандиозные преобразования по централизация власти и профессионализации армии, осуществленные при Амире Темуре к началу XV в. снивелировали политические возможности южночагатайских племен. Но и после этого караунасы не сходят с политической арены. Их «осколками» к середине XV в. стали племена никудерийцев (никудери) и хазарейцев (хазари), которые проживали в пределах Кабульских владений. Часть их продолжала тогда говорить на монгольском языке. В период двадцатилетних междоусобиц Темуридов после смерти Шахруха хазарейцы и никудерийцы тревожили грабежами и набегами городские области Хорасана. Их воинственную активность не смогли усмирить ни Абу-л-Касим Бабур (1452–1457), ни Абу Саид (1451–1468/9), захвативший Хорасан в 1458 г.. Определенное спокойствие наступило при Султане Хусейне. Но уже в конце XV в. потомок Хулагидов Зу-н-Нун-бек Аргун, получив от темуридского правителя в управление области Гура и Систана, подчинил хазарийцев и никудерийцев, и основал независимое государство со столицей в Кандагаре ([7], С.11,340–341,362).

     Таким образом, на протяжении двух веков караунасы были исключительно дееспоспособной военно-политической силой Чагатайского улуса, превосходившей своим потенциалом более патриархальные, но этнически более целостные монголо-тюркские племена. Занимая стратегические области в окрестностях Гиндукуша, они контролировали основные трассы между Индией, Средней Азией и Ираном. Это обстоятельство включало их в важнейшие политические события XIII–XV вв.. Никакая другая племенная группа улуса Чагатаев не оставила столь значительного следа в истории, что требует проявления к ним более пристального внимания исследователей этой эпохи.